前作「StarHorse3 SeasonⅡ BLAZE OF GLORY」（以下、SeasonⅡ）をプレイしていた方は、ゲームデータ（一部を除く）を引き継ぐことができます。
→ 引き継がれます。
●廐舎名 ●勝負服 ●廐舎レベル・廐舎ポイント ●セレブランク
●所持ＳＨ・累積ＳＨ ●アイテム ●サイロ飼葉 ●パートナー廐舎設定
●カジノスロットのスタホタイム状態
以上のデータを引き継ぐことが可能です。
→ 初期化（リセット）されます。
●通算獲得賞金 ●通算成績 ●通算所有頭数 など、
廐舎・競走馬・騎手・レジェンドホースに関する通算成績は、全て初期化（リセット）されます。
※ウイニングラリーに関しては後述します。
→ 引き継がれます。ただし３歳馬は古馬になります。
競走馬・騎手の能力や、WBC出走権・JGP出場権・代数・血統などは、 全て引き継がれます。 ただし、前5走成績のうち、『1着馬（2着馬）』の馬名は非表示となります。
バージョンアップにより、競走馬の能力が低下することはありません。
SeasonⅡからSeasonⅢへの引き継ぎでは
前5走成績が引き継がれるようになるため、
データ引き継ぎによって競走馬のオッズが悪くなることはなく、
バージョンアップが無かった場合と比べ、有利・不利はありません。
→ 引き継がれます。
SeasonⅠ、SeasonⅡで生産された殿堂馬も、マスターズカップへの出走が可能です。
StarHorse2 FINAL DESTINATIONで生産された殿堂馬はマスターズカップへの出走ができません。
→ 引き継がれます。
→ 全てのランキングデータが初期化（リセット）されます。
SeasonⅠ、SeasonⅡで生産（募集）された競走馬（騎手）は、殿堂馬（殿堂騎手）ランキングには登録されません。
→ バージョンアップ直前までの成績に応じて買い取りとなります。
レジェンドホースを所有したままログアウトされていた場合、バージョンアップ直前までの成績に応じて買い取りとなります。
※ゲーム内でレジェンドホースの履歴はご覧になれません。
※レジェンドホースが獲得した賞金（メダル）、ＳＨ、ウイニングラリー勝利マークは、
全て次回ログイン時に受け取ることができます。
→ 引き継がれます。
ただしSeasonⅢで廃止となるレースは、新設されるレースやスタンプカードに振り替えられます。
●各グレードの「達成」「未達成」の状況は、そのまま引き継がれます。
●SeasonⅠ/SeasonⅡの両方に存在するレースの勝利マークはそのまま引き継がれます。
●SeasonⅢで廃止となる次のレースの勝利マークは新設されるレースに振り替えられます。
| 廃止となるレース | 振り替え先となるレース | |
| ジャパンカップダート | → | チャンピオンズカップ |
| 中山記念 | → | スプリングステークス |
| ダイヤモンドステークス | → | 京成杯オータムハンデキャップ |
| 毎日杯 | → | 函館記念 |
| マーメイドステークス | → | 福島牝馬ステークス |
| 新潟記念 | → | 小倉記念 |
| 朝日チャレンジカップ | → | チャレンジカップ |
| 六甲ステークス | → | 京洛ステークス |
| メトロポリタンステークス | → | 札幌日経オープン |
| カシオペアステークス | → | 米子ステークス |
●SeasonⅢで廃止となる次のレースの勝利マークは、スタンプカード（スタンプ３０個獲得済み）に交換されます。
| 廃止となるレース | スタンプカード還元枚数 | |
| 東海ステークス | → | 3枚（スタンプ90個） |
| 阪神牝馬ステークス | → | 3枚（スタンプ90個） |
| エルムステークス | → | 2枚（スタンプ60個） |
※スタンプカードの最大所持枚数は９９枚です。これを超える分は破棄されてしまいますので、ご注意ください。
●SeasonⅢで新設される次のレースは、勝利マークを獲得した状態になります。
| 新設となるレース |
| 川崎記念 |
| ドバイシーマクラシック |
| シンガポール国際カップ |
| 香港マイル |